More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3305 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  100 
 
 		 408 aa  801    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  53.83 
 
 		 525 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  55.28 
 
 		 515 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  55.28 
 
 		 515 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  53.64 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  52.21 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  51.52 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  52.94 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  50.34 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  53.32 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  50.63 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  51.73 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  53.48 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  51.21 
 
 		 489 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  50.75 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  49.75 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  51.08 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  49.88 
 
 		 486 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  50.12 
 
 		 486 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  50.12 
 
 		 486 aa  348  9e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  47.79 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  50.24 
 
 		 509 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  48.81 
 
 		 496 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  48.81 
 
 		 496 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  49.12 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  48.29 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  48.29 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  47.24 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  49.87 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  49.62 
 
 		 441 aa  339  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  49.16 
 
 		 487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  47.82 
 
 		 512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.54 
 
 		 471 aa  335  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  47.73 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  47.42 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  47.73 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  48.11 
 
 		 506 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  47.88 
 
 		 507 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  48.58 
 
 		 507 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  46.36 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  46.88 
 
 		 462 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  44.44 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  44.06 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  45.39 
 
 		 478 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  44.5 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  44.02 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  46.49 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  45.7 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  45.45 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.64 
 
 		 1262 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  45.45 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  45.45 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  46.21 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  43.1 
 
 		 1209 aa  298  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  44.33 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  44.74 
 
 		 416 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  44.25 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  44.25 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  45.23 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  44.99 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  44.5 
 
 		 408 aa  296  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.94 
 
 		 1018 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  44.74 
 
 		 409 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  45.15 
 
 		 416 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 717 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  46.65 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  44.44 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.52 
 
 		 1322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  47.06 
 
 		 440 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  46.8 
 
 		 416 aa  289  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  46.4 
 
 		 442 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.8 
 
 		 1016 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  46.86 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  44.5 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  45.78 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  42.07 
 
 		 417 aa  285  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  45.48 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  43.98 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  43.18 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  44.87 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  42.11 
 
 		 426 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  42.13 
 
 		 437 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  43.49 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  44.07 
 
 		 421 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  45.32 
 
 		 406 aa  279  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  43.18 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  42.16 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  41.88 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.22 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  43.84 
 
 		 414 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  42.58 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  45.61 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  42.72 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  44.01 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  43.9 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  41.65 
 
 		 489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  45.07 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.83 
 
 		 1264 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  39.77 
 
 		 514 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  42.25 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>