More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2435 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  100 
 
 
471 aa  919    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  67.87 
 
 
478 aa  611  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  69.26 
 
 
478 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  55.88 
 
 
446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  56.76 
 
 
444 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  52.11 
 
 
518 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  54.9 
 
 
468 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  51.54 
 
 
515 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  51.54 
 
 
515 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  51.66 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  53.12 
 
 
461 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  52.58 
 
 
584 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  53.86 
 
 
435 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  53.86 
 
 
435 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  50.94 
 
 
525 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  49.78 
 
 
441 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  48.8 
 
 
511 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  46.07 
 
 
506 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  50.82 
 
 
497 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  48.3 
 
 
469 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  50.95 
 
 
458 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  47.92 
 
 
445 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  51.67 
 
 
449 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  47.83 
 
 
483 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  51.14 
 
 
461 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  48.01 
 
 
488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  48.22 
 
 
512 aa  353  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  47.47 
 
 
441 aa  353  5e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  47.02 
 
 
408 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  48.45 
 
 
509 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  46.88 
 
 
486 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  46.88 
 
 
486 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  47.54 
 
 
433 aa  339  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  48.81 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  47.3 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  46.45 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  47.44 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  47.15 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  47.07 
 
 
506 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  44.93 
 
 
541 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  47.61 
 
 
489 aa  333  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  47.41 
 
 
482 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  43.86 
 
 
495 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  44.98 
 
 
507 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  47.63 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  44.47 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  44.58 
 
 
514 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  45.34 
 
 
476 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  49.29 
 
 
442 aa  326  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  46.36 
 
 
1209 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  48.05 
 
 
490 aa  323  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  45.88 
 
 
488 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  45.74 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  45.74 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  44.52 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  45.48 
 
 
441 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  43.06 
 
 
433 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  43.4 
 
 
539 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  46.99 
 
 
439 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  45.64 
 
 
421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  43.59 
 
 
414 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  42.42 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  44.12 
 
 
437 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.69 
 
 
1018 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 
717 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  45.56 
 
 
416 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  40.73 
 
 
416 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  40.73 
 
 
416 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  40.73 
 
 
416 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  42.01 
 
 
416 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  41.42 
 
 
416 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  41.42 
 
 
416 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  44.88 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  40.73 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  41.88 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.86 
 
 
1016 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  40.96 
 
 
416 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  43.46 
 
 
409 aa  303  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  44.85 
 
 
426 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  40.55 
 
 
416 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  46.05 
 
 
462 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  44.29 
 
 
433 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  45.45 
 
 
414 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  41.78 
 
 
416 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  43.89 
 
 
422 aa  296  8e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  42.05 
 
 
417 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  42.19 
 
 
416 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  42.76 
 
 
449 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  44.03 
 
 
409 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.03 
 
 
1262 aa  292  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  41.25 
 
 
407 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  42.11 
 
 
1322 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  44.63 
 
 
435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  41.86 
 
 
416 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  43.06 
 
 
417 aa  289  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  42.43 
 
 
433 aa  289  7e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  43.32 
 
 
452 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  43.46 
 
 
446 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  44.14 
 
 
440 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  43.36 
 
 
420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>