More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02901 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  75.21 
 
 
482 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  100 
 
 
476 aa  936    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  69.47 
 
 
486 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  69.67 
 
 
486 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  69.47 
 
 
486 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  68.85 
 
 
487 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  67.8 
 
 
496 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  67.8 
 
 
496 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  68.02 
 
 
490 aa  611  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  66.6 
 
 
489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  65.11 
 
 
497 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  51.3 
 
 
515 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  51.3 
 
 
515 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  52.21 
 
 
525 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  51.9 
 
 
518 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  51.73 
 
 
408 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  47.69 
 
 
511 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  49.18 
 
 
488 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  49.43 
 
 
506 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  48.35 
 
 
446 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  48.54 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  47.07 
 
 
460 aa  338  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  48.28 
 
 
441 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  48.82 
 
 
584 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  45.15 
 
 
461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  44.18 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  46.88 
 
 
462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  46.1 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  48.3 
 
 
435 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  48.3 
 
 
435 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  47.73 
 
 
458 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  47.68 
 
 
461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  45.04 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  46.73 
 
 
440 aa  319  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  44.2 
 
 
468 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  46.12 
 
 
449 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  46.9 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  47.62 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  47.04 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  45.73 
 
 
507 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  47.38 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  45.73 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  46.21 
 
 
442 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  45.96 
 
 
507 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.62 
 
 
471 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  45.5 
 
 
442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  46.54 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  46.08 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  46.58 
 
 
509 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  43.88 
 
 
414 aa  302  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  43.91 
 
 
512 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  44.79 
 
 
421 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  41.28 
 
 
469 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  44.28 
 
 
441 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  42.96 
 
 
416 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  41.83 
 
 
433 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  42.96 
 
 
416 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  42.48 
 
 
416 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  42.48 
 
 
416 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  42.48 
 
 
416 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  42.48 
 
 
408 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  42.23 
 
 
416 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  42.23 
 
 
416 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  42.23 
 
 
416 aa  289  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  43.81 
 
 
420 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  46.1 
 
 
416 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  44.34 
 
 
416 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.71 
 
 
1016 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  43.66 
 
 
409 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  45.52 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  41.44 
 
 
426 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  41.39 
 
 
416 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  43.99 
 
 
415 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  41.67 
 
 
416 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  40.78 
 
 
407 aa  279  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  43.63 
 
 
414 aa  279  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  41.5 
 
 
416 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  41.52 
 
 
437 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
717 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  44.31 
 
 
406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  39.22 
 
 
1209 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  45.41 
 
 
417 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  42.62 
 
 
409 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  39.39 
 
 
422 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.9 
 
 
1262 aa  270  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  43.71 
 
 
420 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  41.98 
 
 
478 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  43.24 
 
 
416 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  45.67 
 
 
417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  43.61 
 
 
381 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.5 
 
 
1322 aa  266  8.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  40.28 
 
 
416 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  41.77 
 
 
417 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  43.16 
 
 
423 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  41.67 
 
 
416 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.67 
 
 
1264 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  39.81 
 
 
417 aa  260  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  40.32 
 
 
449 aa  260  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  44.69 
 
 
416 aa  259  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  42.42 
 
 
422 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>