More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4745 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  100 
 
 
514 aa  1027    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  62.17 
 
 
488 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  43.34 
 
 
446 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  38.78 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  40.49 
 
 
469 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.33 
 
 
471 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  41.85 
 
 
478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  41.85 
 
 
478 aa  306  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  41.97 
 
 
444 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  41.44 
 
 
525 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  38.69 
 
 
515 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  38.69 
 
 
515 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  44.47 
 
 
461 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  40.76 
 
 
511 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  40.35 
 
 
445 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  40.5 
 
 
468 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  40.8 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  38.54 
 
 
518 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  39.77 
 
 
408 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  38.99 
 
 
461 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  38.69 
 
 
433 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  37.63 
 
 
441 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  40.09 
 
 
435 aa  269  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  40.09 
 
 
435 aa  269  7e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  37.79 
 
 
478 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  38.7 
 
 
460 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  40.92 
 
 
449 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  40.64 
 
 
497 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  40.23 
 
 
483 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.65 
 
 
495 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.62 
 
 
1016 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.19 
 
 
1322 aa  250  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  37.93 
 
 
437 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  38.19 
 
 
476 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  39.06 
 
 
509 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  35.29 
 
 
539 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 
1209 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  37.92 
 
 
458 aa  244  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  40.14 
 
 
422 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  35.75 
 
 
433 aa  243  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  38.46 
 
 
482 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  38.32 
 
 
584 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.91 
 
 
1262 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  36.26 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  38.15 
 
 
417 aa  239  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  36.89 
 
 
437 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.14 
 
 
1018 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
717 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  38.3 
 
 
433 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  36.89 
 
 
488 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  37.17 
 
 
433 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  35.98 
 
 
474 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  36.89 
 
 
441 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  35.78 
 
 
414 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  35.41 
 
 
496 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  35.41 
 
 
496 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  37.3 
 
 
486 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  39.96 
 
 
481 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  38.36 
 
 
507 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  38.36 
 
 
506 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  38.93 
 
 
489 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  37.21 
 
 
525 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  35.35 
 
 
407 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  38.58 
 
 
507 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  35.48 
 
 
486 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  35.48 
 
 
486 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  36.63 
 
 
441 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  39.04 
 
 
441 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_1862  predicted protein  35.81 
 
 
431 aa  224  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2892  ammonium transporter  38.36 
 
 
404 aa  224  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0140736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  33.04 
 
 
644 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  38.6 
 
 
462 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  36.7 
 
 
441 aa  219  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  33.76 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  37.28 
 
 
512 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  34.85 
 
 
487 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  37.9 
 
 
439 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  36.25 
 
 
437 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  37 
 
 
490 aa  216  7e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  37.28 
 
 
442 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  35.4 
 
 
442 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27877  predicted protein  34.26 
 
 
521 aa  210  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  36.62 
 
 
467 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  34.76 
 
 
427 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  35.63 
 
 
452 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.08 
 
 
904 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  34.52 
 
 
449 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.18 
 
 
1264 aa  207  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  35.88 
 
 
446 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  35.87 
 
 
409 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  34.52 
 
 
429 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  34.35 
 
 
411 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  34.36 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  35.78 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  32.3 
 
 
611 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  34.6 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  34.36 
 
 
410 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  33.73 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  39.55 
 
 
416 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  34.12 
 
 
410 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>