More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10881 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  100 
 
 
434 aa  869    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  73.96 
 
 
437 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_1862  predicted protein  69.59 
 
 
431 aa  620  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  58.53 
 
 
441 aa  495  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  59.27 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  52.51 
 
 
539 aa  445  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27877  predicted protein  56.12 
 
 
521 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  42.53 
 
 
433 aa  298  9e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  42.3 
 
 
471 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  40.41 
 
 
478 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  40.41 
 
 
478 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  41.19 
 
 
461 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  36.7 
 
 
514 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  37.64 
 
 
515 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  39.32 
 
 
461 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  37.64 
 
 
515 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  37.69 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  36.72 
 
 
435 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  36.72 
 
 
435 aa  233  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  36.63 
 
 
525 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  38.04 
 
 
468 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  38.55 
 
 
446 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.88 
 
 
445 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  35.78 
 
 
541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  35.94 
 
 
433 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  36.38 
 
 
469 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  34.09 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45928  Amt family transporter: ammonium  35.01 
 
 
517 aa  216  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.401156  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  35.21 
 
 
460 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.86 
 
 
1016 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  36.67 
 
 
478 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  35.02 
 
 
437 aa  209  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  36.87 
 
 
441 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.19 
 
 
1018 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  36.09 
 
 
449 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  34.95 
 
 
441 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.67 
 
 
497 aa  206  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  36.59 
 
 
408 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  38.64 
 
 
441 aa  203  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 
1209 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  37.24 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  36.57 
 
 
489 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  35.65 
 
 
506 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  35.43 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  35.81 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  39.77 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  34.02 
 
 
483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  37.35 
 
 
442 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  35.4 
 
 
441 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  35.45 
 
 
458 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.43 
 
 
422 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  35.16 
 
 
511 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  35.27 
 
 
439 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  33.56 
 
 
488 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  34.16 
 
 
509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  36.51 
 
 
488 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  34.92 
 
 
644 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  33.78 
 
 
584 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
717 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  35.51 
 
 
482 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35 
 
 
1322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  34.39 
 
 
506 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  34.16 
 
 
507 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  34.23 
 
 
433 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.95 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  31.57 
 
 
611 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  33.56 
 
 
417 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  34.16 
 
 
507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.78 
 
 
1262 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  33.64 
 
 
471 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  36.76 
 
 
525 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  33.63 
 
 
476 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  32.73 
 
 
496 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  32.73 
 
 
496 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  31.82 
 
 
426 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1788  Rh-like protein/ammonium transporter  31.59 
 
 
496 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  35.65 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  32.73 
 
 
461 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  34.94 
 
 
452 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  32.73 
 
 
447 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  32.65 
 
 
555 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.67 
 
 
904 aa  170  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  31.24 
 
 
486 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  31.24 
 
 
486 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  31.24 
 
 
486 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  31.8 
 
 
408 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  32.76 
 
 
391 aa  168  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.77 
 
 
1264 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  34.17 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  35.77 
 
 
408 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  35.77 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  35.21 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  33.41 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  31.92 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  33.11 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  33.26 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  33.33 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  31.97 
 
 
416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  37.29 
 
 
449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  36.93 
 
 
440 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>