More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54981 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  100 
 
 		 539 aa  1095    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27877  predicted protein  56.85 
 
 		 521 aa  508  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  55.61 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  56.12 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  53.13 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  52.51 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_1862  predicted protein  53.04 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  41.99 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  43.4 
 
 		 471 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  42.83 
 
 		 478 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  41.21 
 
 		 478 aa  270  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  40.18 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  38.18 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  38.27 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  37.71 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  35.79 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  35.29 
 
 		 514 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  36.36 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.42 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  38.57 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  33.55 
 
 		 525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  36.9 
 
 		 407 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  36.87 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  35.37 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  37.73 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  35.41 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  35.41 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  36.58 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  33.26 
 
 		 1209 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  36.4 
 
 		 435 aa  223  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  36.4 
 
 		 435 aa  223  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  34.86 
 
 		 488 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  39.44 
 
 		 449 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.2 
 
 		 1016 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 717 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  36.36 
 
 		 458 aa  220  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  33.06 
 
 		 1322 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  34.07 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  38.28 
 
 		 478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  38.66 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  34.31 
 
 		 483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  35.68 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  35.8 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45928  Amt family transporter: ammonium  31.26 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.401156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  34.98 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  34.61 
 
 		 506 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  37.5 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  33.55 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  37.78 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  35.84 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  34.67 
 
 		 417 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  33.48 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  33.86 
 
 		 497 aa  203  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  34.76 
 
 		 507 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.11 
 
 		 1018 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  34.55 
 
 		 506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  31.26 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  33.53 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.95 
 
 		 1262 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  37.73 
 
 		 442 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  34.76 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  34.42 
 
 		 611 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  34.82 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  32.37 
 
 		 488 aa  197  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  30.8 
 
 		 644 aa  193  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  32.88 
 
 		 408 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  35.16 
 
 		 482 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  34.23 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  34.13 
 
 		 414 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  35.82 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.35 
 
 		 421 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  32.89 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  34.44 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  33.63 
 
 		 416 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  32.67 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  32.69 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  33.63 
 
 		 416 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  33.63 
 
 		 416 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  35.2 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  34.49 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  33.48 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  33.41 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  31.84 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  33.55 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  31.28 
 
 		 555 aa  183  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  33.19 
 
 		 416 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  32.44 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  33.19 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  33.33 
 
 		 411 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  33.19 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  33.19 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  34.08 
 
 		 411 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  35.39 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  35.01 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  35.75 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  33.33 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  34.51 
 
 		 416 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  31.72 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  33.03 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  33.33 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>