More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2954 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  100 
 
 
488 aa  970    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  62.17 
 
 
514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  45.12 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.99 
 
 
471 aa  334  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  41.34 
 
 
478 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  42.89 
 
 
541 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  42.32 
 
 
478 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  42.25 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  41.9 
 
 
525 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  40.38 
 
 
506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  40.09 
 
 
445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  41.69 
 
 
408 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  38.52 
 
 
469 aa  300  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  40.51 
 
 
518 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  43.52 
 
 
460 aa  299  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  41.08 
 
 
515 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  41.08 
 
 
515 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  42.32 
 
 
435 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  42.32 
 
 
435 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  41 
 
 
511 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  40.89 
 
 
468 aa  292  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  40 
 
 
461 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  42.27 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  44.39 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  42.25 
 
 
584 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  41.74 
 
 
458 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  38.75 
 
 
441 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  41.75 
 
 
497 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  41.38 
 
 
437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  41.13 
 
 
478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  41.84 
 
 
482 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  37.88 
 
 
433 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  40.18 
 
 
483 aa  269  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  39.73 
 
 
509 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.89 
 
 
1018 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  39.95 
 
 
476 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  40.96 
 
 
512 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  42.72 
 
 
496 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  42.72 
 
 
496 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  41.2 
 
 
441 aa  259  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  41.07 
 
 
489 aa  259  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  36.45 
 
 
539 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 
1209 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
717 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  38.78 
 
 
507 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.55 
 
 
1016 aa  256  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  42.07 
 
 
486 aa  256  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  38.78 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  42.34 
 
 
486 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  42.34 
 
 
486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  40.51 
 
 
422 aa  253  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  39.42 
 
 
488 aa  253  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  39.19 
 
 
433 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  39.56 
 
 
490 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  36.52 
 
 
433 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  36.32 
 
 
417 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  37.5 
 
 
507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  39.68 
 
 
441 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  41.53 
 
 
487 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  33.54 
 
 
495 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  40.44 
 
 
441 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  37.27 
 
 
414 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  38.44 
 
 
439 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  36.9 
 
 
489 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  35.1 
 
 
407 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.43 
 
 
1322 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  36.67 
 
 
437 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  39.13 
 
 
442 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  35.12 
 
 
611 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  34.85 
 
 
441 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  34.83 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  35.47 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  35.83 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  38.16 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  36.26 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  35.83 
 
 
416 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  35.83 
 
 
416 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  35.83 
 
 
416 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  36.59 
 
 
409 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  37.02 
 
 
452 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  35.44 
 
 
416 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.4 
 
 
1262 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.4 
 
 
904 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  35.44 
 
 
555 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  34.43 
 
 
462 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  35.28 
 
 
429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  35.1 
 
 
434 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  35.97 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  35.23 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  35.63 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  38.2 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  34.63 
 
 
446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  35.79 
 
 
426 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  35.15 
 
 
416 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  35.15 
 
 
416 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  37.31 
 
 
481 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  36.36 
 
 
416 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  34 
 
 
471 aa  212  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  36.07 
 
 
416 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  34.92 
 
 
416 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>