More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1530 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  100 
 
 
512 aa  1017    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  55.68 
 
 
518 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  53.88 
 
 
511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  58.6 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  58.6 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  59.45 
 
 
584 aa  448  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  58.82 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  56.36 
 
 
509 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  49.78 
 
 
506 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  49.78 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  49.78 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  49.08 
 
 
525 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  48.33 
 
 
446 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  47.38 
 
 
497 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  47.56 
 
 
471 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  47.59 
 
 
408 aa  356  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  47.62 
 
 
478 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  47.72 
 
 
488 aa  343  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  47.17 
 
 
478 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  49.43 
 
 
435 aa  341  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  49.43 
 
 
435 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  47.51 
 
 
444 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  44.93 
 
 
462 aa  335  7.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  47.51 
 
 
460 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  45.17 
 
 
468 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  42.86 
 
 
445 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  45.56 
 
 
489 aa  326  7e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  44.87 
 
 
441 aa  326  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  46.54 
 
 
496 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  45.06 
 
 
433 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  46.54 
 
 
496 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  43.5 
 
 
461 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  44.01 
 
 
476 aa  313  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  44.65 
 
 
490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  41.89 
 
 
478 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  45.16 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  45.16 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  44.34 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  43.01 
 
 
437 aa  303  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  41.19 
 
 
416 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  45.41 
 
 
482 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  41.19 
 
 
416 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  42.73 
 
 
447 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  38.7 
 
 
469 aa  297  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  41.63 
 
 
416 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  41.48 
 
 
408 aa  296  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  44.39 
 
 
449 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  39.65 
 
 
416 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  43.5 
 
 
483 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  40.39 
 
 
416 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  43.15 
 
 
416 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.78 
 
 
495 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  42.96 
 
 
487 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  42.23 
 
 
420 aa  286  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  41.7 
 
 
446 aa  286  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  43.48 
 
 
440 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  40 
 
 
441 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  41.81 
 
 
409 aa  282  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  42.86 
 
 
458 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  39.73 
 
 
414 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  41.1 
 
 
426 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  41.4 
 
 
435 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  42.42 
 
 
421 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  40 
 
 
416 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  41.43 
 
 
409 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  40.97 
 
 
416 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  39.87 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  40.89 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  41.79 
 
 
461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  41.91 
 
 
442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  41.39 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  41.23 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  44.18 
 
 
415 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  42.23 
 
 
420 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  39.61 
 
 
441 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  42.51 
 
 
416 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  40.75 
 
 
416 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  37.67 
 
 
541 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  42.08 
 
 
381 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  39.77 
 
 
449 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  37.16 
 
 
525 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  41.16 
 
 
414 aa  259  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
717 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  39.15 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  38.58 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0172  Rh family protein/ammonium transporter  42.13 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030893  normal  0.412572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  40.45 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  41.42 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  42.2 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  40.22 
 
 
489 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  36.22 
 
 
437 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1788  Rh-like protein/ammonium transporter  37.72 
 
 
496 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  41.56 
 
 
422 aa  249  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  38.91 
 
 
414 aa  249  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>