More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0187 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  100 
 
 
452 aa  875    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  64.95 
 
 
489 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  54.29 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  48.69 
 
 
433 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  45.05 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  45.37 
 
 
444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  43.57 
 
 
408 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  43.36 
 
 
468 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  45.24 
 
 
461 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  40.92 
 
 
511 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  43.93 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  42.29 
 
 
518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  40.57 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  44.47 
 
 
458 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  41.51 
 
 
435 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  43.78 
 
 
471 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  40.54 
 
 
525 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  41.51 
 
 
435 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  40.85 
 
 
445 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  40.5 
 
 
515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  40.5 
 
 
515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  39.24 
 
 
469 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  39.39 
 
 
506 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.19 
 
 
495 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  41.97 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  40.04 
 
 
584 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  42.25 
 
 
506 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  42.25 
 
 
507 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  43.61 
 
 
478 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  43.15 
 
 
478 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  41.8 
 
 
507 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  43.47 
 
 
489 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  41.98 
 
 
497 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  38.51 
 
 
525 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  39.55 
 
 
461 aa  255  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  43.57 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  42.86 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  39.49 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  39.07 
 
 
488 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  39.32 
 
 
449 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  36.85 
 
 
414 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  39.68 
 
 
421 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  41.77 
 
 
476 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  36.26 
 
 
416 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  41.81 
 
 
486 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  41.81 
 
 
486 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  41.09 
 
 
486 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  35.81 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  35.81 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  35.81 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  36.47 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  36.7 
 
 
416 aa  243  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  38.6 
 
 
417 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  35.59 
 
 
416 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  40.82 
 
 
512 aa  242  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  35.36 
 
 
416 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  35.36 
 
 
416 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  35.09 
 
 
416 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  38.79 
 
 
416 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  35.55 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  37.38 
 
 
416 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  38.14 
 
 
416 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  37.14 
 
 
433 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.32 
 
 
1262 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  37.38 
 
 
409 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  40.75 
 
 
496 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  40.75 
 
 
496 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  39.17 
 
 
416 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  36.43 
 
 
426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  38.35 
 
 
414 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  40.76 
 
 
487 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.52 
 
 
1322 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  38.11 
 
 
420 aa  230  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  37.91 
 
 
437 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  36.96 
 
 
1209 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  39.68 
 
 
441 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  38.26 
 
 
422 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  37.76 
 
 
409 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  37.38 
 
 
416 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  36.04 
 
 
541 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  35.78 
 
 
416 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  39.45 
 
 
462 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  39.07 
 
 
423 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  38.64 
 
 
417 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  35.83 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  37.23 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  37.76 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  39.67 
 
 
439 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  34.36 
 
 
391 aa  219  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  36.19 
 
 
407 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0172  Rh family protein/ammonium transporter  38.11 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030893  normal  0.412572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
717 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  39.47 
 
 
442 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  37.2 
 
 
481 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  36.06 
 
 
514 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0233  ammonium transporter  38.62 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0507426  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  38.52 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  38.34 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.47 
 
 
1016 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  34.41 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>