More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0643 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  100 
 
 		 391 aa  774    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  40.8 
 
 		 416 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  39.75 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  39.07 
 
 		 416 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  39.05 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  40.55 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  39.8 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  39.8 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  39.8 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  40.34 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  40.3 
 
 		 409 aa  289  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  40.54 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  38.81 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  38.81 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  39.8 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  39.22 
 
 		 437 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  40.92 
 
 		 416 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  40.39 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  39.14 
 
 		 426 aa  282  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  41.13 
 
 		 447 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  40.55 
 
 		 409 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  38.59 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  40.1 
 
 		 414 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  38.08 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  39.61 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  40.82 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  40.82 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  40 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  41.52 
 
 		 406 aa  268  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  37.35 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  41.55 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  40.29 
 
 		 415 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  39.41 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  38.65 
 
 		 444 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  39.18 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  37.29 
 
 		 525 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  34.69 
 
 		 506 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  38.16 
 
 		 420 aa  259  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  40 
 
 		 417 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  40.16 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  40.44 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  36.58 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0233  ammonium transporter  40.94 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0507426  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  40.05 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  35.99 
 
 		 515 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  35.99 
 
 		 515 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0136  putative ammonium transporter  39.8 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000107717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  39.37 
 
 		 471 aa  252  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  39.08 
 
 		 462 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0172  Rh family protein/ammonium transporter  38.44 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030893  normal  0.412572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  38.69 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  38.41 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  35 
 
 		 511 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  34.4 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  39.51 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  36.76 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  37.14 
 
 		 584 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  37.05 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  36.45 
 
 		 488 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  37.1 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  35.64 
 
 		 408 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  35.17 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  35.47 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  35.17 
 
 		 478 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  35.96 
 
 		 446 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  36.52 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 717 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  35.35 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  36.75 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  34.55 
 
 		 509 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  35.08 
 
 		 512 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.42 
 
 		 1018 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  35.92 
 
 		 407 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  35.43 
 
 		 644 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.38 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  35.24 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  34.69 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  32.85 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  34.58 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  34.7 
 
 		 611 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  33.79 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  32.56 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.68 
 
 		 1016 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  33.79 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  34.79 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  32.86 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  34.67 
 
 		 437 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  32.87 
 
 		 496 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  32.87 
 
 		 496 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.82 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  32.08 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  33.89 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  31.62 
 
 		 486 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  31.62 
 
 		 486 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  33.18 
 
 		 490 aa  209  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  33.79 
 
 		 507 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  34.16 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.16 
 
 		 1262 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  33.72 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 1209 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>