More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0422 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  100 
 
 		 429 aa  840    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  84.85 
 
 		 427 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  59.9 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  52.6 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  52.08 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.71 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  54.48 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  52.64 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  52.47 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  52.91 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  53.03 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  53.03 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  53.03 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  52.46 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  53.03 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  53.12 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  53.03 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  49.89 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  53.03 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  53.03 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  53.03 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  56.65 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  52.31 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  52.55 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  52.61 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  51.48 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.63 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.3 
 
 		 500 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  52.06 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  51.06 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.05 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.51 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.29 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.29 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.29 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.8 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  50.22 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.05 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  52.06 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.29 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  52.06 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  52.06 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  49.65 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.02 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  53.75 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  50.59 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  53.75 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  50.47 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.05 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  49.18 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  51.36 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  52.66 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  52.46 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.91 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  52.46 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  51.28 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.08 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.06 
 
 		 489 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  51.73 
 
 		 438 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  52.78 
 
 		 497 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  52.78 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.95 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  48.94 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  48.37 
 
 		 507 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  52.16 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  51.24 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.75 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  49.3 
 
 		 441 aa  359  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  49.02 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  48.63 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  51.14 
 
 		 445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  52.61 
 
 		 423 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  48.63 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  48.77 
 
 		 405 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  48.64 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  47.97 
 
 		 461 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  49.29 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  50.47 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.22 
 
 		 462 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  48.29 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.94 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  50.12 
 
 		 402 aa  348  9e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  50.12 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  48.44 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  48.42 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.63 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  48.19 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  48.07 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  48.07 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  48.07 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  51.91 
 
 		 445 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  49.38 
 
 		 408 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  47.02 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  49.16 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  49.15 
 
 		 443 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  49.63 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  49.16 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  48.9 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  49.4 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>