More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1788 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1788  Rh-like protein/ammonium transporter  100 
 
 
496 aa  1007    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  45.79 
 
 
506 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  41.75 
 
 
518 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  42.79 
 
 
511 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  42.13 
 
 
515 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  42.13 
 
 
515 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  38.76 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  39.68 
 
 
525 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  39.73 
 
 
408 aa  250  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  39 
 
 
476 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  39.46 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  36.99 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  37.08 
 
 
512 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  41.46 
 
 
468 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  40.7 
 
 
482 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  37.39 
 
 
496 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  37.39 
 
 
496 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  41.06 
 
 
584 aa  231  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  37.11 
 
 
489 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  38.53 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  37.97 
 
 
471 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  39 
 
 
490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  38.86 
 
 
1209 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  35.16 
 
 
446 aa  222  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.54 
 
 
1262 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  40.59 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  39.9 
 
 
487 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  39.45 
 
 
486 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  35.4 
 
 
445 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  39.45 
 
 
486 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  36.3 
 
 
478 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37 
 
 
904 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  38.05 
 
 
507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  38.05 
 
 
506 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  34.55 
 
 
441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  38.15 
 
 
440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  38.94 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  37.81 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  33.33 
 
 
437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  33.18 
 
 
416 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  35.45 
 
 
439 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  36.12 
 
 
478 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.89 
 
 
433 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  32.83 
 
 
1322 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  39.11 
 
 
507 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  37.53 
 
 
461 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  35.04 
 
 
449 aa  210  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
717 aa  209  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  32.52 
 
 
416 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  32.52 
 
 
416 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  32.74 
 
 
416 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  35.24 
 
 
611 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  32.74 
 
 
416 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  32.74 
 
 
416 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  32.52 
 
 
416 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  32.44 
 
 
408 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  32.96 
 
 
421 aa  207  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  32.52 
 
 
416 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  34.94 
 
 
495 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  39.65 
 
 
435 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  34.06 
 
 
541 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  32.42 
 
 
416 aa  204  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  32.73 
 
 
414 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  38.1 
 
 
446 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  32.67 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  34.59 
 
 
461 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  33.71 
 
 
416 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  35.68 
 
 
462 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  33.86 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  32.96 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  34.84 
 
 
460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  32.96 
 
 
416 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  33.11 
 
 
416 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  33.63 
 
 
409 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  35.19 
 
 
417 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  36.57 
 
 
447 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  34.16 
 
 
414 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  31.84 
 
 
426 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  33.09 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  33.64 
 
 
414 aa  190  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  33.19 
 
 
409 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  32.72 
 
 
417 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  33.25 
 
 
644 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  33.77 
 
 
483 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  32.89 
 
 
416 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  34.63 
 
 
442 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  34.37 
 
 
406 aa  187  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  34.84 
 
 
441 aa  187  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  31.83 
 
 
469 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  32.58 
 
 
420 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  33.09 
 
 
433 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  34.6 
 
 
514 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  32.19 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.28 
 
 
1018 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.22 
 
 
1016 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  31.49 
 
 
415 aa  180  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  34.08 
 
 
416 aa  179  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  31.93 
 
 
407 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  33.11 
 
 
420 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  33.18 
 
 
381 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>