More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0967 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  100 
 
 		 976 aa  1999    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  42.31 
 
 		 985 aa  758    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  47.25 
 
 		 965 aa  873    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  37.92 
 
 		 946 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  35.18 
 
 		 1008 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.25 
 
 		 1054 aa  220  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 1211 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  25.91 
 
 		 1034 aa  204  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  25.63 
 
 		 1004 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 1030 aa  191  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  24.48 
 
 		 987 aa  188  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.92 
 
 		 1276 aa  184  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  24.63 
 
 		 949 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.29 
 
 		 1075 aa  169  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25 
 
 		 1397 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.6 
 
 		 1370 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  23.52 
 
 		 1018 aa  164  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 1453 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  23.71 
 
 		 1105 aa  158  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.7 
 
 		 1258 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  23.22 
 
 		 977 aa  155  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  22.54 
 
 		 1384 aa  154  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.04 
 
 		 1374 aa  152  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.02 
 
 		 1114 aa  151  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  23.26 
 
 		 1366 aa  151  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06201  Putative signal protein with GGDEF domain  24.34 
 
 		 973 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.72 
 
 		 1070 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00965  Putative signal protein with GGDEF domain  24.34 
 
 		 973 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.051643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  22.83 
 
 		 1355 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.43 
 
 		 1355 aa  145  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.55 
 
 		 1378 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 		 1237 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  23.74 
 
 		 990 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  23.74 
 
 		 990 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.54 
 
 		 1374 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  23.57 
 
 		 1278 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  22.83 
 
 		 1407 aa  141  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  23.17 
 
 		 1024 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  21.61 
 
 		 1250 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  21 
 
 		 1342 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  24.97 
 
 		 1526 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  23.56 
 
 		 1346 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  21.24 
 
 		 1373 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  23.24 
 
 		 1013 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.5 
 
 		 1005 aa  136  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.65 
 
 		 1070 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 1226 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.39 
 
 		 1053 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  21.82 
 
 		 975 aa  134  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  22.42 
 
 		 1306 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  24.87 
 
 		 1009 aa  131  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  23.22 
 
 		 1017 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  22.63 
 
 		 1327 aa  131  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  40.31 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.51 
 
 		 1079 aa  129  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.93 
 
 		 1340 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 546 aa  128  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.57 
 
 		 1313 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 1498 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 554 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.18 
 
 		 1093 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  45.06 
 
 		 560 aa  125  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.21 
 
 		 1400 aa  125  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  22.96 
 
 		 1378 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  23.65 
 
 		 1404 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  22.74 
 
 		 1351 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  21.62 
 
 		 1349 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 486 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.55 
 
 		 1185 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 486 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 486 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 486 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.52 
 
 		 609 aa  121  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3305  diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 286 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 485 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.28 
 
 		 1505 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.01 
 
 		 1335 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  21.92 
 
 		 1086 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  41.46 
 
 		 485 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  24.36 
 
 		 1175 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  36.19 
 
 		 443 aa  119  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  23.02 
 
 		 1190 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.39 
 
 		 1179 aa  118  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  21.78 
 
 		 1515 aa  118  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  40.24 
 
 		 485 aa  118  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.87 
 
 		 1334 aa  118  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  41.9 
 
 		 568 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  36.72 
 
 		 495 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 342 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4124  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 485 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.66 
 
 		 1242 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  37.57 
 
 		 301 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0384  diguanylate cyclase  39.63 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 323 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 382 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 753 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2623  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  36.57 
 
 		 626 aa  115  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.616722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 320 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 307 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 320 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>