More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2140 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 1453 aa  780    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1211 aa  2460    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 1254 aa  413  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 1295 aa  341  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 1004 aa  309  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1030 aa  291  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  51.04 
 
 		 588 aa  284  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.77 
 
 		 652 aa  279  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  48.55 
 
 		 1756 aa  274  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.36 
 
 		 737 aa  272  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 1018 aa  271  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  45.45 
 
 		 497 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 		 651 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  41.24 
 
 		 737 aa  265  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  49.31 
 
 		 604 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 1258 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  28.13 
 
 		 1013 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 604 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  40.17 
 
 		 365 aa  249  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 		 604 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.39 
 
 		 1885 aa  238  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.1 
 
 		 965 aa  238  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  29.07 
 
 		 1008 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  27.1 
 
 		 1278 aa  228  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  40 
 
 		 471 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  39.67 
 
 		 471 aa  221  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.45 
 
 		 1075 aa  211  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.76 
 
 		 1105 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.13 
 
 		 1346 aa  208  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  25.36 
 
 		 976 aa  208  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.03 
 
 		 1407 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  26.48 
 
 		 985 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  27.6 
 
 		 1017 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 1498 aa  188  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  25.12 
 
 		 1024 aa  185  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  24.17 
 
 		 946 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  24.34 
 
 		 1327 aa  181  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.88 
 
 		 1397 aa  180  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  27.26 
 
 		 1175 aa  179  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.29 
 
 		 1370 aa  177  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  26.35 
 
 		 1009 aa  171  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.36 
 
 		 1832 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.68 
 
 		 1114 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  21.97 
 
 		 1363 aa  168  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  21.21 
 
 		 1070 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.81 
 
 		 1070 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  24.1 
 
 		 1418 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.04 
 
 		 1276 aa  162  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.12 
 
 		 1374 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  23.14 
 
 		 1334 aa  159  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  23.51 
 
 		 1313 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  23.27 
 
 		 1366 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  24.25 
 
 		 1378 aa  158  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.3 
 
 		 1118 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.47 
 
 		 1526 aa  155  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 1004 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.23 
 
 		 1093 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  22.79 
 
 		 1335 aa  152  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  22.29 
 
 		 1306 aa  152  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.67 
 
 		 1373 aa  151  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  24.79 
 
 		 1378 aa  151  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.02 
 
 		 1355 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.95 
 
 		 1404 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  19.95 
 
 		 1316 aa  150  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  23.31 
 
 		 1342 aa  148  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  21.56 
 
 		 1384 aa  148  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  24.89 
 
 		 1388 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  21.68 
 
 		 1347 aa  146  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  23.94 
 
 		 1194 aa  145  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.78 
 
 		 1053 aa  144  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.39 
 
 		 1185 aa  144  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  22.22 
 
 		 987 aa  143  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  20.87 
 
 		 1054 aa  141  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 		 1079 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.86 
 
 		 1086 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  20.79 
 
 		 1373 aa  140  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 1181 aa  139  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.71 
 
 		 1242 aa  139  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  21.6 
 
 		 1414 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  22.42 
 
 		 1374 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 801 aa  129  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  21.19 
 
 		 1340 aa  128  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  22.09 
 
 		 1351 aa  127  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  22.2 
 
 		 1093 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  21.65 
 
 		 1005 aa  125  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  32.44 
 
 		 1311 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  22.44 
 
 		 1324 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.32 
 
 		 812 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  22.56 
 
 		 1298 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  22.2 
 
 		 1355 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  23.08 
 
 		 1182 aa  122  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  21.59 
 
 		 1250 aa  121  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 1226 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  22.27 
 
 		 1349 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.51 
 
 		 1135 aa  119  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  20.9 
 
 		 975 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 807 aa  118  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  22.69 
 
 		 1063 aa  115  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>