More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1225 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  100 
 
 		 985 aa  2020    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  42.49 
 
 		 976 aa  773    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  40.64 
 
 		 946 aa  712    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  44.94 
 
 		 965 aa  873    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  39.18 
 
 		 1008 aa  592  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.29 
 
 		 1054 aa  260  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.71 
 
 		 1034 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  26.56 
 
 		 1004 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 1018 aa  233  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 1030 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 1453 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  26.32 
 
 		 1105 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  25.45 
 
 		 1070 aa  212  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 1211 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.86 
 
 		 1075 aa  203  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.55 
 
 		 1407 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  23.84 
 
 		 949 aa  201  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  24.35 
 
 		 1070 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.15 
 
 		 1276 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  24.18 
 
 		 1342 aa  191  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06201  Putative signal protein with GGDEF domain  26.07 
 
 		 973 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00965  Putative signal protein with GGDEF domain  26.07 
 
 		 973 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.051643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 1258 aa  183  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  24.51 
 
 		 1306 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  25.18 
 
 		 1340 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.68 
 
 		 1370 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  24.6 
 
 		 1024 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  24.75 
 
 		 1378 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  22.58 
 
 		 987 aa  171  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  24.63 
 
 		 1378 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.07 
 
 		 1114 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25.79 
 
 		 1327 aa  167  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.32 
 
 		 1053 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  25 
 
 		 1013 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  22.7 
 
 		 1374 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.6 
 
 		 1351 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  22.68 
 
 		 977 aa  164  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  25.33 
 
 		 1250 aa  163  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  23.65 
 
 		 1374 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  22.96 
 
 		 975 aa  161  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 1226 aa  161  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  26.65 
 
 		 1175 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.95 
 
 		 1397 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  23.3 
 
 		 1334 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.92 
 
 		 1346 aa  156  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  22.91 
 
 		 1118 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  22.08 
 
 		 1316 aa  154  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  25.3 
 
 		 1355 aa  151  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  21.35 
 
 		 1404 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 447 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  23.43 
 
 		 1017 aa  146  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  21.13 
 
 		 1086 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  24.74 
 
 		 990 aa  145  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.06 
 
 		 1498 aa  145  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  24.74 
 
 		 990 aa  145  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  21.45 
 
 		 1515 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.16 
 
 		 1355 aa  144  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43.83 
 
 		 560 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  22.84 
 
 		 1278 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.6 
 
 		 1363 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  22.01 
 
 		 1366 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  25.26 
 
 		 1009 aa  140  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.09 
 
 		 1335 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  40.58 
 
 		 443 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.06 
 
 		 609 aa  139  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  21.69 
 
 		 1005 aa  138  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.13 
 
 		 1396 aa  137  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  22.4 
 
 		 1384 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  22.96 
 
 		 1349 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.82 
 
 		 1313 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  25 
 
 		 1185 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  21.03 
 
 		 1414 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  43.95 
 
 		 427 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.35 
 
 		 772 aa  132  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  41.62 
 
 		 568 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  36.68 
 
 		 565 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  41.11 
 
 		 556 aa  131  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.84 
 
 		 1511 aa  131  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3489  GGDEF domain-containing protein  39.7 
 
 		 312 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0384  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 486 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 486 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 486 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 486 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 486 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.79 
 
 		 1400 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  33.18 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 753 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.76 
 
 		 1526 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  19.44 
 
 		 1347 aa  128  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  33.33 
 
 		 340 aa  128  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.15 
 
 		 550 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.41 
 
 		 314 aa  127  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 487 aa  127  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 387 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.66 
 
 		 1373 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 498 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 319 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 477 aa  126  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 370 aa  126  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>