More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4161 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1295 aa  2626    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1338 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
1211 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.13 
 
 
1453 aa  338  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
1254 aa  302  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
1004 aa  298  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.71 
 
 
737 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
503 aa  278  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  48.05 
 
 
588 aa  278  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
516 aa  274  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
651 aa  274  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 
652 aa  272  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 
604 aa  270  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  47.3 
 
 
1756 aa  269  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  46.98 
 
 
737 aa  266  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  43.52 
 
 
365 aa  256  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  48.68 
 
 
604 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  41.23 
 
 
497 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
604 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  43.19 
 
 
1885 aa  238  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  30.79 
 
 
471 aa  214  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  31.39 
 
 
471 aa  214  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.94 
 
 
1832 aa  164  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  24.69 
 
 
1033 aa  135  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
807 aa  129  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  26.11 
 
 
1031 aa  125  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
801 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  24.36 
 
 
1048 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 
1204 aa  113  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
990 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  28.67 
 
 
423 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  20.47 
 
 
976 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.75 
 
 
1074 aa  102  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
971 aa  91.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.68 
 
 
1258 aa  91.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 
1262 aa  90.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
862 aa  89.4  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
839 aa  88.2  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  23.99 
 
 
1187 aa  87.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 
716 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
856 aa  87.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
559 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  25.23 
 
 
1258 aa  86.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 
850 aa  85.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.21 
 
 
1301 aa  85.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 
850 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
760 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.2 
 
 
963 aa  83.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
1021 aa  83.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.99 
 
 
516 aa  83.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
1062 aa  82  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
873 aa  82  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0861202  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
584 aa  82  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
1089 aa  82  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0717  two component signal transduction sensor lacking kinase domain  38.24 
 
 
103 aa  81.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.841552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  25.57 
 
 
482 aa  81.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
1036 aa  80.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.58 
 
 
1193 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
915 aa  80.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  33.49 
 
 
693 aa  80.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 
989 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.33 
 
 
975 aa  80.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  23.95 
 
 
1934 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0716  histidine kinase  40.59 
 
 
119 aa  80.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.856156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 
819 aa  80.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
557 aa  79.7  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.79 
 
 
819 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  24.7 
 
 
959 aa  79.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.66 
 
 
890 aa  80.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 
848 aa  79.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  27.61 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 
989 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  24.27 
 
 
895 aa  79  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  25.22 
 
 
811 aa  79  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  29.84 
 
 
680 aa  78.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 
1075 aa  78.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  25.5 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.55 
 
 
516 aa  78.2  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
644 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
1669 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.17 
 
 
1805 aa  78.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
467 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55780  putative two-component sensor  25.87 
 
 
922 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  22.62 
 
 
1366 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  23.92 
 
 
524 aa  77  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 
848 aa  77.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
848 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 
640 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.12 
 
 
636 aa  77.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 
1134 aa  77  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
652 aa  77  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  25.47 
 
 
505 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.16 
 
 
1901 aa  76.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
396 aa  76.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
552 aa  76.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
1085 aa  76.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>