More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0716 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0716  histidine kinase  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.856156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 651 aa  90.9  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  46.53 
 
 		 471 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 1004 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  46.53 
 
 		 471 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  43.96 
 
 		 365 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 516 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 1254 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.07 
 
 		 1885 aa  80.5  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 1295 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 652 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 604 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  41.3 
 
 		 497 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 1211 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.63 
 
 		 1832 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  38.71 
 
 		 1756 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 737 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 1453 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 604 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  40.22 
 
 		 604 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.86 
 
 		 416 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  34.07 
 
 		 588 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 461 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.23 
 
 		 1845 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 773 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1513  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 423 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  44.32 
 
 		 1379 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  33.75 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 592 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  32.77 
 
 		 592 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.58 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 692 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 662 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 803 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 733 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  39.8 
 
 		 615 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.79 
 
 		 1685 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 484 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.46 
 
 		 1822 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  36.96 
 
 		 737 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 439 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 356 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  36.17 
 
 		 420 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  36.17 
 
 		 420 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0037  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 337 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0884  histidine kinase  36 
 
 		 454 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.456358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 		 1685 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 513 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  44.05 
 
 		 670 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  35.79 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 848 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 901 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.77 
 
 		 771 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  41.98 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 708 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  34.62 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  34.88 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 495 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3832  sporulation kinase  36.46 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000527947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3161  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.19 
 
 		 681 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.36 
 
 		 417 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  35.42 
 
 		 1836 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 801 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  34.34 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 671 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  40 
 
 		 659 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  41.56 
 
 		 635 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 630 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  35.24 
 
 		 666 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 636 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 851 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 1000 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 591 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  36 
 
 		 455 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  38 
 
 		 647 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0197  histidine kinase  33.98 
 
 		 436 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  36.36 
 
 		 655 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 671 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  34.34 
 
 		 608 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.34 
 
 		 608 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  34.34 
 
 		 608 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  34.34 
 
 		 608 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  34.34 
 
 		 608 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  34.34 
 
 		 608 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  31.63 
 
 		 537 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 527 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1550  sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 420 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000335626 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 556 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  37.23 
 
 		 685 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  38.64 
 
 		 852 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0367  sensor histidine kinase  36.63 
 
 		 672 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>