More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3030 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
801 aa  1658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 
807 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
645 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
645 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
986 aa  183  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
904 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
1741 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
1266 aa  154  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  24.1 
 
 
1092 aa  152  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 
773 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.94 
 
 
989 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.24 
 
 
1086 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
1676 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
1122 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 
1092 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.85 
 
 
989 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  25.62 
 
 
1086 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.69 
 
 
696 aa  145  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0252232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  25.99 
 
 
1289 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2094  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.48 
 
 
291 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2411  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.37 
 
 
313 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2134  diguanylate cyclase  47.37 
 
 
313 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.298927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.34 
 
 
1418 aa  135  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
540 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
1516 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  28.74 
 
 
1019 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 
531 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1116 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.32 
 
 
924 aa  131  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.04 
 
 
1453 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.67 
 
 
1278 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
1254 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
1211 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 
1275 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
1965 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  25.47 
 
 
1248 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 
834 aa  125  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  29.43 
 
 
423 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
641 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1700  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.05 
 
 
767 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
1341 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
743 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  29.47 
 
 
914 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 
767 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.61 
 
 
1182 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.13 
 
 
945 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.23 
 
 
754 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
1295 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  31.88 
 
 
497 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  33.19 
 
 
685 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0993  putative sensor protein  24.87 
 
 
1105 aa  119  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.7374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01973  predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein  24.87 
 
 
1105 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01962  hypothetical protein  24.87 
 
 
1105 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  33.82 
 
 
853 aa  118  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  28.81 
 
 
471 aa  118  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.83 
 
 
1070 aa  118  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1165  putative sensor protein  24.62 
 
 
1105 aa  118  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.807956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2360  putative sensor protein  24.62 
 
 
1105 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.8 
 
 
764 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  28.94 
 
 
471 aa  117  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
3706 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.14 
 
 
1078 aa  117  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
682 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
745 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
1390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.37 
 
 
1105 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  24.71 
 
 
684 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 
845 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.51 
 
 
1428 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1574  putative sensor protein  24.37 
 
 
1105 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115387  normal  0.924629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
841 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  23.94 
 
 
556 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
929 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
844 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
1068 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 
727 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
557 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 
1002 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.07 
 
 
791 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.75 
 
 
1007 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.11 
 
 
1212 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1945  putative PAS/PAC sensor protein  41.13 
 
 
676 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.62 
 
 
823 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.47 
 
 
578 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
2693 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2666  putative sensor protein  23.6 
 
 
1129 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0614  putative PAS/PAC sensor protein  30.86 
 
 
727 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8657800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
851 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.29 
 
 
958 aa  111  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  25.04 
 
 
1255 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0390  ligand-binding sensor domain-containing protein  29.18 
 
 
1275 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  25.75 
 
 
1560 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  25.89 
 
 
918 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
552 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
1121 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  23.22 
 
 
852 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>