23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0717 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0717  two component signal transduction sensor lacking kinase domain  100 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.841552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 1453 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 1211 aa  93.6  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 1254 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  41.58 
 
 		 497 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  40.2 
 
 		 737 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 737 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 651 aa  83.6  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 1004 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 1295 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  35.29 
 
 		 588 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 652 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  37.25 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 604 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 516 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.89 
 
 		 1885 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 604 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 503 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 604 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.67 
 
 		 1832 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  34.31 
 
 		 1756 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  36.27 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  36.27 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>