More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2497 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  100 
 
 		 1031 aa  2073    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  40.2 
 
 		 1033 aa  700    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  41.75 
 
 		 1048 aa  723    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1204 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 742 aa  144  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.15 
 
 		 422 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.61 
 
 		 387 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 508 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 1295 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  29.3 
 
 		 1009 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 581 aa  125  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  34.07 
 
 		 431 aa  122  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  40.87 
 
 		 717 aa  121  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  39.23 
 
 		 362 aa  121  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  29.57 
 
 		 1013 aa  120  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  34.91 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 652 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  34.03 
 
 		 402 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 517 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  33.21 
 
 		 397 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 434 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 1030 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  36.4 
 
 		 432 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  39.15 
 
 		 433 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.85 
 
 		 2361 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 411 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  36.24 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 1338 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  30.89 
 
 		 1017 aa  112  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.12 
 
 		 430 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 401 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  33.86 
 
 		 403 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 412 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 351 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 351 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 442 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  106  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 662 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 682 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  31.58 
 
 		 351 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 584 aa  105  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  34.01 
 
 		 662 aa  105  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 596 aa  104  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 414 aa  104  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  36.03 
 
 		 401 aa  104  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  33.18 
 
 		 413 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 391 aa  104  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  33.33 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 595 aa  104  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  32.91 
 
 		 596 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  34.72 
 
 		 409 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 406 aa  103  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  24.44 
 
 		 1017 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 351 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 725 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  34.7 
 
 		 389 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  33.33 
 
 		 407 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 381 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 370 aa  101  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 402 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 771 aa  100  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  31.56 
 
 		 413 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 438 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 564 aa  100  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 594 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  23.26 
 
 		 1093 aa  99.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.04 
 
 		 1024 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  35.92 
 
 		 282 aa  99  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 598 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  36.96 
 
 		 433 aa  99  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.56 
 
 		 598 aa  98.6  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 381 aa  98.6  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  32.61 
 
 		 671 aa  98.2  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  34.69 
 
 		 459 aa  97.8  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.34 
 
 		 643 aa  97.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  30.87 
 
 		 683 aa  97.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 344 aa  97.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 501 aa  97.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 372 aa  97.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 393 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 591 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  36.08 
 
 		 485 aa  95.9  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 775 aa  95.9  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 665 aa  95.5  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  32.1 
 
 		 447 aa  95.5  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 682 aa  95.1  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 403 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 661 aa  95.1  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  23.24 
 
 		 1046 aa  95.1  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  35.12 
 
 		 403 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>