More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_84 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  100 
 
 
1084 aa  2221    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  28.82 
 
 
1070 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  27.65 
 
 
1070 aa  379  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.38 
 
 
1407 aa  322  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  25.44 
 
 
1105 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.89 
 
 
1118 aa  316  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.34 
 
 
1370 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.76 
 
 
1397 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  25.92 
 
 
1355 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.42 
 
 
1374 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.76 
 
 
1526 aa  290  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.75 
 
 
1388 aa  290  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.75 
 
 
1306 aa  284  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  24.47 
 
 
1400 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  23.57 
 
 
1355 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  23.2 
 
 
1278 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  24.26 
 
 
1378 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  24.3 
 
 
1384 aa  267  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.77 
 
 
1335 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  24.52 
 
 
1378 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  23.36 
 
 
1363 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  23.86 
 
 
1342 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  23.48 
 
 
1373 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  23.42 
 
 
1327 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  23.96 
 
 
1373 aa  238  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 
1498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  22.51 
 
 
1175 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  24.46 
 
 
1086 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  24.25 
 
 
1340 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  24.01 
 
 
1093 aa  233  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
1258 aa  230  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.84 
 
 
1396 aa  227  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.84 
 
 
1351 aa  227  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  23.13 
 
 
1347 aa  222  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  21.84 
 
 
1418 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.9 
 
 
1404 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.61 
 
 
1114 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  23.01 
 
 
1313 aa  218  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  25.23 
 
 
1316 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.52 
 
 
1334 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  22.29 
 
 
1366 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.27 
 
 
1054 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  22.19 
 
 
1349 aa  207  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  21.42 
 
 
1191 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  24.51 
 
 
1004 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.99 
 
 
1181 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  21.2 
 
 
1185 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.55 
 
 
1278 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  23.08 
 
 
1024 aa  191  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  23.46 
 
 
1346 aa  191  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  23.39 
 
 
1194 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  29.74 
 
 
1074 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  21.21 
 
 
1374 aa  177  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  27.16 
 
 
1374 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  21.64 
 
 
1298 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.62 
 
 
1079 aa  170  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  21.71 
 
 
1347 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  21.15 
 
 
1414 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  24.03 
 
 
1034 aa  165  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  22.33 
 
 
1250 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  35.34 
 
 
426 aa  157  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 
1237 aa  151  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  21.58 
 
 
921 aa  149  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
433 aa  148  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.1 
 
 
1226 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  22.72 
 
 
1141 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1312  sensor histidine kinase  36.05 
 
 
510 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  29.54 
 
 
392 aa  145  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  19.89 
 
 
1190 aa  144  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  34.19 
 
 
607 aa  144  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1395  sensory box sensor histidine kinase  34.7 
 
 
534 aa  144  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0315  sensory box sensor histidine kinase  35.5 
 
 
534 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  19.85 
 
 
1179 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  20.84 
 
 
1063 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  29.74 
 
 
1366 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
765 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  24.79 
 
 
1311 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
646 aa  140  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
827 aa  140  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0178  sensor histidine kinase  30.12 
 
 
596 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0305  sensory box sensor histidine kinase  33.6 
 
 
425 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  23.3 
 
 
1344 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0175  histidine kinase  30.12 
 
 
597 aa  138  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_167  sensor histidine kinase  31.15 
 
 
589 aa  137  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.69 
 
 
1276 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
725 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
640 aa  136  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
371 aa  135  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
695 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
718 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
546 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
733 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
534 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
743 aa  132  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  31.84 
 
 
392 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 
1242 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
641 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
382 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>