More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1539 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  100 
 
 		 392 aa  795    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  89.26 
 
 		 392 aa  720    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1395  sensory box sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0171  sensory box sensor histidine kinase  37.13 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0315  sensory box sensor histidine kinase  36.12 
 
 		 534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0305  sensory box sensor histidine kinase  36.26 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 607 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  33.58 
 
 		 759 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 955 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 871 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0178  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 596 aa  156  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 582 aa  154  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 682 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 680 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  36.51 
 
 		 1070 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 827 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 568 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 1069 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1312  sensor histidine kinase  38.11 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  35.68 
 
 		 1070 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.19 
 
 		 823 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  31.64 
 
 		 1118 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 947 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_167  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 589 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 862 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1007 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0175  histidine kinase  30.31 
 
 		 597 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 631 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 1041 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1260 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 		 1313 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 903 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 776 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.32 
 
 		 1258 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 637 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 573 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1158 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 763 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 780 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.32 
 
 		 1629 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 673 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 628 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 		 745 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 642 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 776 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 841 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 977 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.51 
 
 		 1407 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 1046 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 767 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2325  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.830525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1287 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1261 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 674 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1009 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  29.91 
 
 		 1119 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 781 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 816 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 553 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 827 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 521 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 1262 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 1068 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2237  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.5102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 680 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  31.84 
 
 		 1084 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 878 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 		 997 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 984 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 765 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  30.31 
 
 		 810 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 778 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 810 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 940 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 		 823 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 1369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 657 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  31 
 
 		 713 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 1237 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  33.18 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  28.06 
 
 		 801 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 896 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  28.06 
 
 		 801 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1085 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3018  histidine kinase  28.94 
 
 		 657 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  27.81 
 
 		 801 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 866 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 		 881 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 801 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  29.71 
 
 		 746 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>