More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3018 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3018  histidine kinase  100 
 
 
657 aa  1294    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  38.89 
 
 
531 aa  287  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
676 aa  280  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
686 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
752 aa  277  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  36.34 
 
 
693 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
700 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
757 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
713 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 
708 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
745 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
744 aa  264  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
739 aa  263  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.04 
 
 
1322 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
744 aa  260  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  36.72 
 
 
847 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
754 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  34.79 
 
 
925 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  36.02 
 
 
650 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  34.29 
 
 
925 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.76 
 
 
923 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  32.48 
 
 
1135 aa  248  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
636 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1040 aa  246  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.02 
 
 
1442 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  36.57 
 
 
647 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
916 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
649 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1436 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
1436 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
922 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
758 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1305 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.73 
 
 
1763 aa  239  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  35.37 
 
 
977 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1765 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  35.41 
 
 
935 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1659 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1550 aa  237  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.52 
 
 
905 aa  237  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  32.95 
 
 
917 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
1202 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.72 
 
 
917 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1069 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
1788 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
917 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1193 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  32.05 
 
 
942 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
833 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
1768 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
812 aa  231  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
682 aa  230  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
914 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
1369 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
816 aa  229  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.59 
 
 
1499 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1326 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1118 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
925 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1767 aa  228  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1771 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
841 aa  227  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
876 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.78 
 
 
950 aa  226  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
1767 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
1767 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
957 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
1267 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
957 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
1316 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  30.57 
 
 
760 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  29.76 
 
 
2035 aa  224  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
950 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
925 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
1398 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0036  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
759 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.488776  normal  0.166978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.1 
 
 
1765 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.44 
 
 
858 aa  224  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
784 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1309 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
1397 aa  223  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
770 aa  223  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
818 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.27 
 
 
933 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.27 
 
 
933 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  33.53 
 
 
936 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
1057 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1284 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1313 aa  221  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.27 
 
 
933 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1165 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  27.61 
 
 
1683 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
909 aa  220  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
1786 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1203 aa  220  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
920 aa  220  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
721 aa  220  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.49 
 
 
1177 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
928 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
1820 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>