More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0107 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 408 aa  845    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  36.52 
 
 		 607 aa  187  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  32.07 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 426 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1395  sensory box sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0315  sensory box sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 534 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0171  sensory box sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  40.28 
 
 		 759 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0305  sensory box sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  35.6 
 
 		 1070 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1312  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 510 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  33.62 
 
 		 1070 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  31.11 
 
 		 729 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 1363 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 709 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 875 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 		 1287 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0175  histidine kinase  29.78 
 
 		 597 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  35.93 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  31.66 
 
 		 1118 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 725 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 628 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1222 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 780 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_002936  DET0178  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 596 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 969 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 		 901 aa  133  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  31.03 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 		 1222 aa  133  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  34.78 
 
 		 1196 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  27.71 
 
 		 746 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 		 933 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 873 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_167  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  26.92 
 
 		 1015 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 944 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 1297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 1069 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  26.58 
 
 		 697 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 549 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 776 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 697 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  32.3 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11841  adaptive-response sensory kinase  32.17 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.250439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 546 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 		 957 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  24.74 
 
 		 713 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 		 776 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 1313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 		 895 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  28.99 
 
 		 669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 604 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 882 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 785 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.63 
 
 		 778 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1088  adaptive-response sensory kinase  32.17 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.330021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  29.8 
 
 		 1084 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 816 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.63 
 
 		 778 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 1596 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 973 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  28.99 
 
 		 683 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 1069 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 1237 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 885 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 881 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.63 
 
 		 778 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 612 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  27.92 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  31.62 
 
 		 547 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 		 637 aa  126  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 558 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 377 aa  126  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 1177 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 906 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 1046 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 		 680 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 637 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 1043 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 781 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 883 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 683 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  31.12 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 772 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 646 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 877 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 		 919 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1207 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  32.44 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 		 1350 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 880 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>