More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1088 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1088  adaptive-response sensory kinase  100 
 
 
372 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.330021  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  95.43 
 
 
372 aa  721    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11671  adaptive-response sensory kinase  90.86 
 
 
372 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11841  adaptive-response sensory kinase  96.77 
 
 
372 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.250439  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  67.12 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  66.04 
 
 
411 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09431  adaptive-response sensory kinase  68.36 
 
 
370 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146733 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  70.91 
 
 
370 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0674  adaptive-response sensory kinase  69 
 
 
381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.384044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  69.27 
 
 
381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  38.42 
 
 
395 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  36.9 
 
 
387 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  38.16 
 
 
401 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  37.23 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  36.93 
 
 
391 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  36.93 
 
 
391 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  37.18 
 
 
387 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  33.51 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
549 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
546 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
556 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
399 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
620 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
725 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
885 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
2783 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
1274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  31.97 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
426 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
641 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1002 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
763 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
944 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
875 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
1133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
695 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  30.77 
 
 
426 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
470 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
1319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
614 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
827 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
2153 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
1017 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
614 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.87 
 
 
762 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  35.74 
 
 
464 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  32.2 
 
 
300 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
687 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
377 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
1014 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
786 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
901 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
755 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
958 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
477 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  27.89 
 
 
952 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
960 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  30.97 
 
 
1127 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
639 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
453 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
718 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
571 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
1252 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
639 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
395 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  32.31 
 
 
463 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
625 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  32.61 
 
 
482 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0074  histidine kinase  32.11 
 
 
492 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
307 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
416 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  27.95 
 
 
397 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
300 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
639 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  28.12 
 
 
337 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
888 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0074  histidine kinase  32.52 
 
 
493 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
418 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
478 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
613 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
1211 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
637 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
610 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.69 
 
 
539 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  30.09 
 
 
400 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
463 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
670 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  29.63 
 
 
392 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
633 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
412 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
587 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
491 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
581 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>