More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5063 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  100 
 
 
393 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  71.76 
 
 
391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  71.76 
 
 
391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  54.64 
 
 
401 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  53.94 
 
 
395 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  53.03 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  53.14 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  43.58 
 
 
387 aa  315  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11841  adaptive-response sensory kinase  37.43 
 
 
372 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.250439  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  37.43 
 
 
372 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1088  adaptive-response sensory kinase  37.23 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.330021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  36.63 
 
 
411 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  37.07 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09431  adaptive-response sensory kinase  36.19 
 
 
370 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146733 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  36.44 
 
 
370 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11671  adaptive-response sensory kinase  35.47 
 
 
372 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0674  adaptive-response sensory kinase  34.2 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.384044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  34.2 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
546 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  33.08 
 
 
910 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
612 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  35.17 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
1174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  34.33 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
695 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
458 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  33.33 
 
 
909 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
592 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
687 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
718 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1274 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
418 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  31.3 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
705 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
944 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
701 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
901 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
663 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
885 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
875 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
899 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
899 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  34 
 
 
613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.3 
 
 
617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
396 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  32.24 
 
 
539 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
473 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
470 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  30.55 
 
 
364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
489 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
359 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
2783 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
592 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  29.81 
 
 
466 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  30.55 
 
 
364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
906 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  32.31 
 
 
512 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
670 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
579 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
851 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  32.03 
 
 
897 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
359 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
969 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
549 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
641 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
581 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
510 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
846 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
395 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  32.92 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
639 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  29.49 
 
 
910 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
2153 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
639 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.4 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
1319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  30.45 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
827 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
556 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
612 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
392 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  30.27 
 
 
915 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
599 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
480 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  28.57 
 
 
468 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
880 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
725 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
668 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
620 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
884 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>