More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2558 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  100 
 
 		 397 aa  796    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  39.72 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  39.72 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  39.72 
 
 		 461 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  37.77 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 568 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 763 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 765 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 456 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1550 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 1305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  37.79 
 
 		 560 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 546 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  41.47 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 767 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 		 1069 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 641 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 875 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 1046 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 		 841 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  37.41 
 
 		 531 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 695 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 885 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 1124 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.78 
 
 		 929 aa  179  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 		 1369 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.54 
 
 		 905 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.43 
 
 		 933 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 911 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 969 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1274 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 718 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.92 
 
 		 926 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.8 
 
 		 1313 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 950 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 925 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 743 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  39.43 
 
 		 617 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 1877 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 919 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.99 
 
 		 882 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  38.67 
 
 		 737 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 947 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.48 
 
 		 941 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 956 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40.08 
 
 		 1177 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.96 
 
 		 937 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 818 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 		 1820 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 639 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.82 
 
 		 948 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 717 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.44 
 
 		 929 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  38.89 
 
 		 565 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  37.18 
 
 		 932 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 780 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.49 
 
 		 1346 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 896 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 818 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 798 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1260 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.63 
 
 		 925 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 985 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 962 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 906 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.47 
 
 		 1499 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 916 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1692 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.82 
 
 		 932 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 579 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 916 aa  170  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  36.25 
 
 		 729 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.78 
 
 		 1407 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 446 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 1131 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 866 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  39.2 
 
 		 942 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.96 
 
 		 853 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1363 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.62 
 
 		 927 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.6 
 
 		 925 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 1853 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.68 
 
 		 968 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 724 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 765 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 893 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.99 
 
 		 918 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.99 
 
 		 918 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 687 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.99 
 
 		 918 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1917 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  39.11 
 
 		 661 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 754 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 833 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 639 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.99 
 
 		 918 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>