More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4050 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  100 
 
 
412 aa  853    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  56.36 
 
 
395 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  54.5 
 
 
387 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  53.5 
 
 
401 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  53.72 
 
 
391 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  53.72 
 
 
391 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  53.14 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  41.29 
 
 
387 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  33.6 
 
 
411 aa  229  7e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11841  adaptive-response sensory kinase  33.68 
 
 
372 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.250439  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  32.55 
 
 
383 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  33.51 
 
 
372 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1088  adaptive-response sensory kinase  33.51 
 
 
372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.330021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09431  adaptive-response sensory kinase  33.15 
 
 
370 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146733 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0674  adaptive-response sensory kinase  34.88 
 
 
381 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.384044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  34.29 
 
 
381 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  33.51 
 
 
370 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11671  adaptive-response sensory kinase  30.81 
 
 
372 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  33.33 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
786 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
483 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  32.2 
 
 
581 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
958 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
587 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
718 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
571 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
1174 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.2 
 
 
1274 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.8 
 
 
463 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
612 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
413 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
944 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
581 aa  123  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
668 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  34.73 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
763 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
592 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
969 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0482  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
691 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  32.8 
 
 
539 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
691 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.582434  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
722 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
453 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
581 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
641 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
695 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
489 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
520 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
579 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
906 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
760 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
473 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30.47 
 
 
581 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  30.83 
 
 
909 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
395 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  29.67 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  32.4 
 
 
1003 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
663 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
599 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  32.5 
 
 
600 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  32.32 
 
 
910 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
639 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
754 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  31.13 
 
 
397 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
705 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
687 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  31.92 
 
 
508 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  34.54 
 
 
607 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
903 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  30.35 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
670 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
606 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
718 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
500 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
883 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
748 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
507 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
932 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
640 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
678 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
821 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  32.76 
 
 
713 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>