More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3171 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  100 
 
 
401 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  79.75 
 
 
395 aa  670    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  56.89 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  54.64 
 
 
393 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  53.5 
 
 
412 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  51.13 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  51.13 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  44.8 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  38.23 
 
 
411 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11841  adaptive-response sensory kinase  38.95 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.250439  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  38.95 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  40.53 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  38.42 
 
 
383 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1088  adaptive-response sensory kinase  38.16 
 
 
372 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.330021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09431  adaptive-response sensory kinase  38.32 
 
 
370 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146733 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11671  adaptive-response sensory kinase  37.37 
 
 
372 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  36.32 
 
 
381 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0674  adaptive-response sensory kinase  36.32 
 
 
381 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.384044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
958 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  34.63 
 
 
607 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.2 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  31.64 
 
 
369 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
369 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
571 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.78 
 
 
617 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
453 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
512 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
610 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.01 
 
 
391 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.13 
 
 
745 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
1174 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
967 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
392 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
745 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
549 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
705 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
722 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.98 
 
 
490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
377 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
944 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
489 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.2 
 
 
581 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
581 aa  119  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
546 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  30.35 
 
 
745 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
608 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  31.32 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  32.3 
 
 
1003 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
902 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
677 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  33.62 
 
 
713 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
887 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
668 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
597 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
887 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
718 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  29.34 
 
 
466 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
620 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
594 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
458 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
378 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  30.04 
 
 
993 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
639 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  29.57 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  29.57 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  28.3 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.15 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.57 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  30.65 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  31.17 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.18 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.57 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.57 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  29.57 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4625  histidine kinase  31.58 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
408 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
483 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  29.15 
 
 
910 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
438 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
612 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.25 
 
 
464 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
456 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
332 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  30.83 
 
 
913 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
889 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
593 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>