More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4625 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4625  histidine kinase  100 
 
 
505 aa  1035    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
895 aa  306  8.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.62 
 
 
926 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  33.93 
 
 
900 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1586  histidine kinase  34.04 
 
 
473 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
961 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  33.19 
 
 
910 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  32.87 
 
 
885 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.27 
 
 
342 aa  250  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  33.55 
 
 
530 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
892 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
530 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
522 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
902 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
888 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.07 
 
 
895 aa  245  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
890 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
902 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
889 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  32.87 
 
 
897 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
947 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
945 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
901 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  31.29 
 
 
1035 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
945 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
947 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
947 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  32.43 
 
 
993 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  32.43 
 
 
954 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  32.43 
 
 
954 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  32.43 
 
 
993 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  32.43 
 
 
993 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
947 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
951 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
897 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  32.36 
 
 
908 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  32.79 
 
 
915 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  32.36 
 
 
908 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  32.36 
 
 
908 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
904 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  32.93 
 
 
895 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  31.85 
 
 
906 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
944 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
944 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  31.66 
 
 
909 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
900 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
949 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  32.12 
 
 
910 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
905 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  31.47 
 
 
907 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
905 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
899 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
884 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  32.36 
 
 
894 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
894 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
884 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
907 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  32.92 
 
 
894 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  32.92 
 
 
895 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  32.36 
 
 
894 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  32.92 
 
 
894 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  32.92 
 
 
894 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  32.92 
 
 
894 aa  210  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  30.8 
 
 
905 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32 
 
 
912 aa  210  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
884 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2153  osmosensitive K channel His kinase sensor  27.25 
 
 
885 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  33.62 
 
 
894 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  33.4 
 
 
894 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
884 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2115  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
885 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  33.4 
 
 
894 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  33.4 
 
 
894 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  30.57 
 
 
938 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
938 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
907 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  32.8 
 
 
905 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  32.85 
 
 
895 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
902 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  30.61 
 
 
937 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
967 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  29.77 
 
 
512 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
902 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.91 
 
 
902 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  32.64 
 
 
905 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
894 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
887 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
907 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  28.14 
 
 
887 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  29.9 
 
 
914 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2489  sensor histidine kinase KdpD  25.53 
 
 
889 aa  195  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.891393  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0060  osmosensitive K channel His kinase sensor  25.53 
 
 
889 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0058  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
889 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  29 
 
 
883 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
503 aa  193  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
951 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
897 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
887 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
887 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
891 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.399581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>