More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1213 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.7 
 
 
926 aa  709    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  100 
 
 
900 aa  1806    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
961 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.99 
 
 
895 aa  623  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
895 aa  601  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  36 
 
 
910 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
902 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  36.28 
 
 
908 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  36.47 
 
 
908 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  36.17 
 
 
908 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  34.97 
 
 
905 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
888 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
947 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
947 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  34.52 
 
 
885 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
947 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
892 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
947 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35 
 
 
890 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
944 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
949 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  34.11 
 
 
906 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.92 
 
 
1035 aa  532  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
945 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
945 aa  532  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
897 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  34.42 
 
 
895 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
894 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
944 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  35.02 
 
 
894 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  34.79 
 
 
910 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  35.02 
 
 
894 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  35.02 
 
 
894 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  34.42 
 
 
894 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
901 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  34.42 
 
 
894 aa  527  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  34.31 
 
 
894 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  34.71 
 
 
905 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  34.49 
 
 
895 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  34.2 
 
 
894 aa  524  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  35.02 
 
 
894 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  34.2 
 
 
894 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  34.53 
 
 
894 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
951 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
897 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
889 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.44 
 
 
993 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  34.44 
 
 
993 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  34.44 
 
 
993 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
887 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
887 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  35.46 
 
 
915 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  33.93 
 
 
895 aa  508  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  35.26 
 
 
909 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  33.62 
 
 
937 aa  506  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
905 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
902 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
907 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  35.1 
 
 
902 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0702  truncated KdpD protein  43.88 
 
 
642 aa  505  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
907 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  34.66 
 
 
897 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
902 aa  502  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  34.73 
 
 
907 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
905 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  34.49 
 
 
905 aa  492  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  33.04 
 
 
902 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2489  sensor histidine kinase KdpD  33.03 
 
 
889 aa  485  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.891393  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0060  osmosensitive K channel His kinase sensor  33.03 
 
 
889 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0058  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
889 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2153  osmosensitive K channel His kinase sensor  31.74 
 
 
885 aa  483  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
899 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2115  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
885 aa  483  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
938 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
900 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
912 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.9 
 
 
938 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
907 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
902 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
900 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
894 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  33.37 
 
 
954 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  33.37 
 
 
954 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
904 aa  466  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
897 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
951 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
967 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0827  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
892 aa  441  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23395  normal  0.0418421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  30.75 
 
 
887 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
887 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
891 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
894 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
884 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0358  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
932 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3078  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
886 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
884 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
896 aa  416  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
884 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  30.1 
 
 
914 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
883 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>