164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3632 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  100 
 
 		 966 aa  1975    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 		 966 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.83 
 
 		 976 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  32.62 
 
 		 959 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  33.54 
 
 		 924 aa  516  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.98 
 
 		 918 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  31.65 
 
 		 966 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 		 947 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  30.52 
 
 		 921 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  25.88 
 
 		 1074 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  27.31 
 
 		 1366 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  25.37 
 
 		 1257 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 1341 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  22.77 
 
 		 1280 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 571 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 1453 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 560 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 545 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  21.72 
 
 		 1313 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.99 
 
 		 1505 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  19.29 
 
 		 1338 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  23.63 
 
 		 1515 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  21.14 
 
 		 1344 aa  81.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.97 
 
 		 1295 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  20.05 
 
 		 1204 aa  79.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  31.75 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  22.36 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.42 
 
 		 1093 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2774  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.69 
 
 		 1419 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3084  sensory box protein  22.75 
 
 		 1422 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.05 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  20.14 
 
 		 1031 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  20.92 
 
 		 1378 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  21.59 
 
 		 1346 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.65 
 
 		 1511 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1464  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.75 
 
 		 1433 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.62 
 
 		 1355 aa  70.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  31.21 
 
 		 1024 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  21.1 
 
 		 1175 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2757  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  20.88 
 
 		 1419 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  22.35 
 
 		 1355 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  24.85 
 
 		 1037 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.39 
 
 		 1316 aa  68.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  24.35 
 
 		 1306 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  20.88 
 
 		 1419 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000359916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.18 
 
 		 1430 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  28.97 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.78 
 
 		 1226 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  22.16 
 
 		 411 aa  67  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1476  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.05 
 
 		 1430 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65929  normal  0.14467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.22 
 
 		 1237 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  25.67 
 
 		 1051 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.86 
 
 		 1526 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  20.8 
 
 		 1349 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.27 
 
 		 1504 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 		 1258 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.02 
 
 		 1504 aa  65.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.02 
 
 		 1276 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  22 
 
 		 985 aa  64.3  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  24.87 
 
 		 1344 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  37.76 
 
 		 1378 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  29.41 
 
 		 1384 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  28 
 
 		 403 aa  62  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.75 
 
 		 1334 aa  61.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  20.54 
 
 		 1373 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.51 
 
 		 1242 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  31.25 
 
 		 603 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  60.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  26.6 
 
 		 1054 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  20.06 
 
 		 1105 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  28.21 
 
 		 409 aa  60.1  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.92 
 
 		 1075 aa  59.7  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.98 
 
 		 1498 aa  59.7  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  23.94 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  26.04 
 
 		 1013 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  24.42 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  30.22 
 
 		 1347 aa  58.9  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.36 
 
 		 1373 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  26.51 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  27.12 
 
 		 1086 aa  58.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  24.6 
 
 		 990 aa  58.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  24.6 
 
 		 990 aa  58.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  24.12 
 
 		 1034 aa  57.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  25.76 
 
 		 1311 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.19 
 
 		 1400 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  20.73 
 
 		 976 aa  57.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.92 
 
 		 1335 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  23.91 
 
 		 1374 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  25.54 
 
 		 1374 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  35.38 
 
 		 155 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  25 
 
 		 1017 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  20.72 
 
 		 977 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  27.01 
 
 		 412 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.6 
 
 		 398 aa  56.2  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  21.79 
 
 		 1278 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  24.19 
 
 		 1363 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.4 
 
 		 1486 aa  55.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  19.41 
 
 		 1009 aa  55.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  21.21 
 
 		 921 aa  55.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>