More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2688 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 937 aa  1917    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 1106 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1407 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 960 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2718  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 803 aa  168  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  30.1 
 
 		 671 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.39 
 
 		 1548 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.68 
 
 		 1287 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1023 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  40 
 
 		 945 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 1267 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 1265 aa  135  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1297 aa  134  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  39.78 
 
 		 1248 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.97 
 
 		 1466 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 1039 aa  129  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1709  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.97 
 
 		 1109 aa  128  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0904197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  45.32 
 
 		 525 aa  127  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.51 
 
 		 1845 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 984 aa  121  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3048  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.93 
 
 		 683 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.86 
 
 		 1561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  42.86 
 
 		 1837 aa  118  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1391 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 865 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  28.23 
 
 		 749 aa  115  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1977 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  39.26 
 
 		 1833 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.61 
 
 		 1258 aa  114  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 1227 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 883 aa  114  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  38.46 
 
 		 1809 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 1266 aa  112  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1643 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 1255 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1068  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.67 
 
 		 714 aa  111  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 931 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  25.83 
 
 		 1346 aa  107  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 910 aa  107  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 1262 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1453 aa  104  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  39.26 
 
 		 474 aa  102  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1311  hypothetical protein  32.97 
 
 		 792 aa  102  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1308  hypothetical protein  32.42 
 
 		 792 aa  101  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1149  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.36 
 
 		 730 aa  102  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 		 696 aa  101  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1182 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 		 1122 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  24.49 
 
 		 1258 aa  99.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 		 868 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 1171 aa  99  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3543  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.97 
 
 		 659 aa  99  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 934 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1268  hypothetical protein  40.17 
 
 		 140 aa  98.2  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.3 
 
 		 820 aa  98.2  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 851 aa  97.8  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 1171 aa  97.8  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.1 
 
 		 862 aa  97.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 		 1959 aa  96.3  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.66 
 
 		 659 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.66 
 
 		 659 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 845 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.46 
 
 		 802 aa  95.1  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.24 
 
 		 810 aa  94.7  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.31 
 
 		 1468 aa  94.4  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.63 
 
 		 1836 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0630  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.96 
 
 		 699 aa  94  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 1068 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 		 664 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1341 aa  91.3  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.2 
 
 		 1324 aa  91.3  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 649 aa  91.3  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.26 
 
 		 664 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 		 637 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 936 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.35 
 
 		 664 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 423 aa  90.1  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.41 
 
 		 1015 aa  90.1  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.26 
 
 		 664 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 1111 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 767 aa  89.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 1291 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0711  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.29 
 
 		 202 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2786  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.22 
 
 		 828 aa  90.1  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532868  normal  0.92327 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 991 aa  89.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 809 aa  89  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 771 aa  88.6  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 771 aa  88.2  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 3706 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.87 
 
 		 687 aa  88.2  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.25746  normal  0.789676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1714 aa  88.2  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1289 aa  87.8  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 		 793 aa  87.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.4 
 
 		 826 aa  87.4  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.825062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0047  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.38 
 
 		 738 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2039  diguanylate cyclase  31.39 
 
 		 432 aa  87  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000319282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1185 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1605  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 688 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0013251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>