81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0711 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0711  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 1297 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.54 
 
 		 1845 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1391 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  30.29 
 
 		 937 aa  89.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1548 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  33.81 
 
 		 1248 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 945 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1287 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.14 
 
 		 1833 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 865 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1977 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 868 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  35.87 
 
 		 1015 aa  78.2  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.88 
 
 		 659 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.88 
 
 		 659 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 1185 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  29.01 
 
 		 1809 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3543  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.52 
 
 		 659 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 851 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  30.71 
 
 		 1837 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  33.61 
 
 		 1836 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 664 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 664 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1255 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 664 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 1267 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 1039 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.58 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 809 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 934 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 1266 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 835 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1407 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.11 
 
 		 1324 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  30.17 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1643 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  35.62 
 
 		 692 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 522 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.48 
 
 		 1653 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 707 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 848 aa  54.7  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 663 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 1171 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3366  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 716 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 942 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4016  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 716 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 1341 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 1171 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 705 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1043 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 371 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 698 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4653  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.94 
 
 		 709 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 586 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.85 
 
 		 679 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 987 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2536  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 829 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 695 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 697 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 683 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 933 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1075 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 652 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 1267 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3682  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 685 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00804168  normal  0.462115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 890 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 1106 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  33.82 
 
 		 531 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.27 
 
 		 2468 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 		 1110 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.11 
 
 		 477 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  28.85 
 
 		 727 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.62 
 
 		 1348 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 581 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 689 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 		 981 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 785 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 1578 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  29.41 
 
 		 354 aa  41.2  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 		 1204 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>