More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05930 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 989 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 989 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 591 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 		 429 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  40.98 
 
 		 130 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 498 aa  91.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.29 
 
 		 426 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 458 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 355 aa  91.3  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 376 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  33.52 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.43 
 
 		 256 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 373 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 		 603 aa  88.6  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 636 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 359 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 953 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 380 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 		 474 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 384 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  37.9 
 
 		 657 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 316 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.97 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.81 
 
 		 701 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  35.38 
 
 		 311 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  27 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 481 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.4 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  38.21 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.4 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 571 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  38.71 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 461 aa  81.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  37.14 
 
 		 667 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  30.32 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  39.34 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  31.14 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  33.77 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  39.05 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  33.56 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 377 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  30.87 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  34.17 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.4 
 
 		 651 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.62 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 650 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  30 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>