More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5158 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5158  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 255 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00149525  decreased coverage  0.000111139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  30.37 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  29.24 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5271  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1136  transcriptional regulator, LuxR family  26.58 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2655  regulatory protein LuxR  25.33 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  24.78 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  49.18 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.45 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0098  transcriptional regulator, LuxR family  27.33 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00697344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1045  regulatory protein LuxR  20.74 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  45 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  40.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  37.1 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  24.85 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  39.02 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  37.1 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3243  regulatory protein LuxR  25.11 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  44.44 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  44.59 
 
 		 916 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  36.05 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.95 
 
 		 824 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  33.7 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.43 
 
 		 876 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  39.34 
 
 		 824 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.21 
 
 		 880 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  42.62 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 680 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 471 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.27 
 
 		 867 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 119 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 461 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  37.14 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.5 
 
 		 921 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.5 
 
 		 921 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.5 
 
 		 921 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.34 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4278  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0894003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 77 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>