More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1672 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1672  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 270 aa  543  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.793356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  34.03 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  34.88 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  27.18 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  31.91 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  26.7 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  26.18 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 188 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.89 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  30.39 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  23.7 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  20.61 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  31.58 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  29.07 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  44.3 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 224 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 394 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 235 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  31.58 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  37.14 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 77 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.14 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3065  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 930 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.14 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.14 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  29.35 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  39.34 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  45.9 
 
 		 947 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  25.14 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 954 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  24.42 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.04 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  39.78 
 
 		 1006 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.82 
 
 		 901 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  32 
 
 		 907 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  44.26 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>