229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5493 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  40.17 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  38.96 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  38.6 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  38.43 
 
 		 320 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9195  transcriptional regulator TraR  37.18 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.391185  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.9 
 
 		 307 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.71 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  29.33 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  26.82 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  22.75 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  24.03 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  27.19 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  26.21 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0066  LuxR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.961932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  28.22 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4428  transcriptional regulator, LuxR family  24.78 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  25.98 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  25.79 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.1 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.1 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.1 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.1 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  29.79 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  24.8 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  25.97 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.94 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.94 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.94 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.94 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.94 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.88 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.09 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.48 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  24.58 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  25.97 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  24.79 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.97 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.65 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>