291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4356 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4356  response regulator receiver protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4045  LuxR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3512  regulatory protein, LuxR  60 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.492486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4915  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  46.67 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 77 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  35.9 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2116  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  44.07 
 
 		 248 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 243 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  34.62 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4065  transcriptional regulator LuxR family  26.72 
 
 		 251 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  37.7 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  32.91 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 394 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4889  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 235 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 231 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.42 
 
 		 425 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1849  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0165336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  35.94 
 
 		 254 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 209 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  47.54 
 
 		 242 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0339  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.0558568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.05 
 
 		 867 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0307  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.1 
 
 		 889 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  35.94 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 500 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>