More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0350 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  24.18 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  26.67 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  27.12 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  27.37 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  31.95 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  29.76 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  26.35 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  26.95 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  27.98 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 799 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2301  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3153  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  27.12 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  25.54 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  24.85 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  24.85 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  23.7 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  27.64 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.73 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.73 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.92 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0514  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  39.34 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0670  regulatory protein LuxR  39.68 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.73 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.73 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.73 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>