More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0670 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0670  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 277 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  50.82 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  53.57 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  55.36 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  54.84 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  57.14 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4720  putative PAS/PAC sensor protein  52.63 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  58.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  52.73 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.73 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  47.54 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.73 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.73 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  44.26 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  50.88 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2045  regulatory protein, LuxR  50.79 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242021  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2240  transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 87 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2048  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0912162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  38.71 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1858  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.968511  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  45.9 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0066  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.961932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1681  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.86 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  42.19 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  42.19 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  45.07 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  43.84 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  48.15 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  45.45 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  45.45 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>