More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2045 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2045  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242021  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2240  transcriptional regulator, LuxR family  93.1 
 
 		 87 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  58.73 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  58.73 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3708  LuxR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  58.06 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4136  LuxR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1729  LuxR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00602837  normal  0.265991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1857  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00288103  normal  0.0218384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 394 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 425 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 242 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  42.19 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  47.62 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  43.28 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 260 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  36.05 
 
 		 247 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 253 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  46.97 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0670  regulatory protein LuxR  50.79 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  49.21 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  46.77 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  42.25 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  39.34 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  45.61 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  36.05 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 244 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  42.25 
 
 		 236 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2048  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0912162  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1858  regulatory protein, LuxR  44.26 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.968511  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4720  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  38.36 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 321 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  40.28 
 
 		 206 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  43.55 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.55 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.55 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 247 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  36.11 
 
 		 298 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 244 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 272 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  40.98 
 
 		 246 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>