More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5553 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5553  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 373 aa  750    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  37.84 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  53.33 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  57.41 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  29.63 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  58.82 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  28.42 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  47.54 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  41.76 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  40 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 230 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.78 
 
 		 205 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 251 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 251 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 242 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  27.93 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 768 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  48.28 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0523  transcriptional regulator, LuxR family  51.11 
 
 		 122 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 285 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0302  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 526 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 		 526 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 		 526 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 262 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 257 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 222 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.07 
 
 		 1021 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3149  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 246 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 309 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 203 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.89 
 
 		 896 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0800  transcriptional regulator, LuxR family protein  44.64 
 
 		 130 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3965  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 129 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0527243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 214 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 227 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.52 
 
 		 894 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 176 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 151 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 246 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 		 260 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>