More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0116 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0116  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4428  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 245 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 245 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 245 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 245 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 245 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  56.63 
 
 		 250 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  62.86 
 
 		 245 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 242 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0066  LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 248 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.961932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 236 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  48.28 
 
 		 247 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.53 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  48.53 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.53 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.53 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  50 
 
 		 247 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 253 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  42.86 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  42.86 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.44 
 
 		 239 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 204 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  45.9 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  43.48 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  45.9 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1858  regulatory protein, LuxR  47.54 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.968511  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2048  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0912162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1702  regulatory protein, LuxR  41.54 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139777  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 226 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.55 
 
 		 295 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 257 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 394 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  42.62 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 259 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  36.36 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  41.94 
 
 		 260 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 258 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  43.08 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  38.81 
 
 		 246 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 225 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 215 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 218 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 304 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>