49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4313 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  100 
 
 		 317 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  37.61 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  34.24 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  31.91 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  30.12 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  31.79 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  29.43 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  28.66 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  29.97 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  25.69 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  31.44 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  25.71 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.65 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  27.13 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  31.1 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 477 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  28.66 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  54.17 
 
 		 149 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0851  two component LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 216 aa  49.7  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0778308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2775  transcriptional regulator TrmB  46.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1531  LuxR family DNA-binding response regulator  30.3 
 
 		 219 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000956559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>