14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2537 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 149 aa  290  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  52.9 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  50 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  54.17 
 
 		 321 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 317 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 341 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  46.15 
 
 		 333 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  58.33 
 
 		 337 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 365 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  43.86 
 
 		 324 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 332 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>