49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8191 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  100 
 
 		 332 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  35.01 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  34.93 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  34.94 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  32.85 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  30.29 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  30.06 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  29.97 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  27.35 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  26.51 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  31.21 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.75 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  29.96 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  35.96 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  26.42 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  25.26 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 241 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  46.43 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  38.03 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 224 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0851  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0778308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>