96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  32.87 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  36.05 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  35.22 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  33.84 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  32.54 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  31.12 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  36.81 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  38.37 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  37.42 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  35.58 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.62 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  27.69 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  33.53 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  23.05 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  31.58 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  49.18 
 
 		 127 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  24.68 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 112 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  37.36 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 188 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 486 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 218 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 486 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 486 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3421  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 82 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.864452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  44.07 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 486 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  39.29 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7175  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 222 aa  42.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 287 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 208 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1702  regulatory protein, LuxR  32.79 
 
 		 238 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139777  normal  0.361431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>