36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0388 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 477 aa  910    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  31.99 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  26.97 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  28.44 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  26.38 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  29.44 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  30.55 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  25.79 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.4 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  27.65 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 112 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  26.38 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  32.33 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4680  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 107 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141979  normal  0.0546255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 328 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  34.85 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  26.71 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 337 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  45.83 
 
 		 221 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.18 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4547  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 321 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 255 aa  43.5  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  46.81 
 
 		 331 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>