130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4680 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4680  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 107 aa  218  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141979  normal  0.0546255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 477 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.85 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  39.06 
 
 		 284 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 228 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 993 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 539 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  34.78 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4314  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 492 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4385  germination protein GerE  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4226  germination protein  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  37.5 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4329  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4629  germination protein GerE  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4609  germination protein GerE  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0626  germination protein GerE  38.24 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  26 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 554 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1604  LuxR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0187  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.38 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 225 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 237 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2151  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  37.14 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  33.33 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 209 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0979  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 526 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 526 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  42  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 526 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2141  hypothetical protein  34.29 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0962248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 398 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3546  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.21 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000843196  hitchhiker  0.00749158 
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  32.79 
 
 		 225 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 242 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  32.79 
 
 		 210 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 245 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 141 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  38.98 
 
 		 242 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 240 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  36.51 
 
 		 220 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3421  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.864452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  38.1 
 
 		 221 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 304 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 250 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 221 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 217 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.77 
 
 		 917 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  31 
 
 		 207 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 303 aa  41.2  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 982 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  32.79 
 
 		 246 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>